а он проходил военную кафедру в вузе?

В гражданской авиации понятие "пиджак" противопоставляется "сапогу", и скорее второе более насмешливое. А первое - типа норм. Горький опыт расставил эти понятия по своим местам.
Там "сапог" - бывший военный летчик, которого или списали или сократили, а он цепляется за профессию и правдами-неправдами (обычно второе) устраивается пилотом гражданской авиации. Но опыт не тот, менталитет не тот, возраст не тот чтобы переучиваться. Этому надо учиться с младых ногтей, а не когда тебе под сороковник. Отсюда и пренебрежительное отношение к "сапогам".